L'approche clinique de la phytothérapie suit les bonnes pratiques de toute consultation médicale. Ainsi, elle se déroule en 3 temps :
- L’interrogatoire dirigé qui permet au phytothérapeute de connaître le motif de consultation du patient et ses antécédents personnels et familiaux ;
- L’examen clinique approfondi pour identifier des déséquilibres physiologiques associés (symptômes, aspect général du patient (posture, éclat du regard...) et éventuellement prescrire des bilans biologiques complémentaires ;
- La prescription de la ou des plantes dont la complémentarité et la synergie favoriseront le retour à l'équilibre physiologique. Pour cela, le phytothérapeute pourra être amené à proposer des préparations magistrales réalisées en pharmacie, mélanges de différentes plantes à associer et à doser de manière individualisée.